ISMbov3
- Family IS1634
- Group
Isoform IS1634Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
AJ829923 | ND | Mycoplasma bovis | Mycoplasma bovis |
DNA section
IS Length : 1873 bp
Ends
IR Length : 13
IRL : CCTACGTTTCCCACTTAGTCGCGAAAACACTCAGTTTTCGGCGGCTATAT
IRR : CCTACGTTTCCCAGTTTAAGCATAAAACAAGAAAACATAATTATGTAAAT
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|
DNA sequence
CCTACGTTTCCCACTTAGTCGCGAAAACACTCAGTTTTCGGCGGCTATATTTTTTTTATAAAAAAAATATAATTTATTATACTTTTATGCTTAAATATGA
TATAATAAAAACATGAAGAAGTCGAAAAACGATGCAAAAGACAATGAAGAACATCAATAGCAAGAGTCAAAAAAGGTGAATACTTATCAATTGGAGTGCC
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AAACATAACTTATGAAATCAAAAATTTACATAATTATGTTTTCTTGTTTTATGCTTAAACTGGGAAACGTAGG
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1602 bp | 533 aa | 184 | 1785 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MSIGVPRPDNKGFVYRLGYGYLHELKQYHDDPLTIIKAIIANFPLSWTKEQARTKLDEIFKEKKETKKEVLERFKGYEVVEKLFDYFNIFNDCSPTKSTT
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QKIETIQVYNDELQESWQTYQILLELLTKEKVT
Blast result :
Comments
ISMbov3 is 97.7% aa identical and 98.5% aa similar to IS1634
References
1] Vilei E.M (2004) Direct submission GenBank