ISMbov8
- Family IS1634
- Group
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
CP002058 | ND | Mycoplasma bovis | Mycoplasma bovis HB0801 |
DNA section
IS Length : 2195 bp
Ends
IR Length : 16/24
IRL : CAACTCATGTGTTTTTGAACTATTTCTCATAATCAAATATGAGCAATGAT
IRR : CATTTCATTAGTGTTTTTAAACTACATCATCTACATTCTAAATTCAAAAT
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
ATTAACCAAAATATTTTG | AAACATAAACAGATGTA | 0 |
DNA sequence
CAACTCATGTGTTTTTGAACTATTTCTCATAATCAAATATGAGCAATGATGTATAATTTTTTTTAGTAAAAATAATACATTGTATAGTTACATGGAGATT
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TAATCACTTTATGCTCGGTGATTTTACTTTTTCCAGTCAGTCCTAATTTTGAATTTAGAATGTAGATGATGTAGTTTAAAAACACTAATGAAATG
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1437 bp | 478 aa | 103 | 1539 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MKEASDIKKVERPKSTVVRNYFGTYKVIRRTSKRVGNKIIPVDVEIVGEIKNNKFVEYLHPIPVGQKKKAKQNIIDIKDYGNIALFINNSNDLLASLNDV
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Blast result :
Comments
ISMbov8 is 54% aa similar to ISMbov5.
References
1] ISfinder submission (2018)
2] Qi,J., Guo,A., Cui,P., Chen,Y., Mustafa,R., Ba,X., Hu,C., Bai,Z., Chen,X., Shi,L. and Chen,H. (2012) PLoS ONE 7 (5), E38239.
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