ISMov1

  • Family IS1595
  • Group IS1016
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
CP011158 ND Moraxella ovis
Moraxella ovis 199/55
DNA section
IS Length : 719 bp

Ends


IR Length : 17

IRL : GGGGCTGTCCTAGATAATGACTAAAAACTCCATTTAGGTTAAAATAACCC
IRR : GGGGCTGTCCTAGATAACTAACCCAAACTGCCCTTAAATAATTGTTTTAA

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
ACTATTATTTATTTTATTTATTTGTTTTACTCAACC0
TAAAAATAAAATTATTTTATTGATTTTTGGCTTACT0
AATTTTTGTTAAAAATTTAAAAATTAATGAACCCTATAC0
TAATTTATAATAAATAAAAAAGCGCATGATTA8
ACTAAGGTGGTATTGTTTTTTATTCATTTTAT8

DNA sequence

GGGGCTGTCCTAGATAATGACTAAAAACTCCATTTAGGTTAAAATAACCCAGTGAGAAAAAGTCGTCTAAGTCAGTACAAACAAAACAAACTCATTGAGC
TGTTTGTTGCAGGTGTTACTGCAAGAACGGCAGCTCAATTAGCCAATGTAAATAAAACAACAGCTGCTTACTATTTTCACCGATTACGCCTACTCATCTA
TCAACACAGTCAGCACCTAGAAATGCTAGATGGCGAAGTTGAAGCTGATGAGAGCTATTTTGGCGGAACACGCAAAGGTAAGTGTGGTCGTGGTGCAAGC
GGTAAGACTGCGGTATTTGGCTTATTAAAGCGAAATGGCAAGGTTTATACCGTTGCCGTACCTAATACAAAGTCAGCCACTTTATTGCCCATTATACGAG
AAAAAGTAAAGCCTGACAGCATTGTTTACACAGATTTCTACGAAAGCTATGATGTGCTTGATGTTAGTGAATTTAATCACTTTGGAATCAATCACAGTAC
GCACTTTGCAGAAAAACAAAATCACATTAACGGAATAGAGAATTTTTGGAATCAGGCAAAACGCCATTTACGCAAATTTAACGGTGTTCCCAAAGAACAC
TTTGAGCTTTATCTTAAAGAATGCGAATGGCATTTTAATAACAGTGACCTTAAATCTCAAATTTCCATTTTAAAACAATTATTTAAGGGCAGTTTGGGTT
AGTTATCTAGGACAGCCCC
Protein section
ORF number : 1

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
651 bp216 aa52702+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MRKSRLSQYKQNKLIELFVAGVTARTAAQLANVNKTTAAYYFHRLRLLIYQHSQHLEMLDGEVEADESYFGGTRKGKCGRGASGKTAVFGLLKRNGKVYT
VAVPNTKSATLLPIIREKVKPDSIVYTDFYESYDVLDVSEFNHFGINHSTHFAEKQNHINGIENFWNQAKRHLRKFNGVPKEHFELYLKECEWHFNNSDL
KSQISILKQLFKGSLG

 

Blast result :
Comments
ISMov1 is 93% aa similar to ISMha3.
References
1] ISfinder annotation (2017)
2] Calcutt,M.J. and Foecking,M.F. (2015) Direct GenBank submission.