ISMov1
- Family IS1595
- Group IS1016
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
CP011158 | ND | Moraxella ovis | Moraxella ovis 199/55 |
DNA section
IS Length : 719 bp
Ends
IR Length : 17
IRL : GGGGCTGTCCTAGATAATGACTAAAAACTCCATTTAGGTTAAAATAACCC
IRR : GGGGCTGTCCTAGATAACTAACCCAAACTGCCCTTAAATAATTGTTTTAA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
ACTATTATTTATTTTATTT | ATTTGTTTTACTCAACC | 0 | |
TAAAAATAAAATTATTTTA | TTGATTTTTGGCTTACT | 0 | |
AATTTTTGTTAAAAATTTA | AAAATTAATGAACCCTATAC | 0 | |
TAATTTATAATA | AATAAAAA | AGCGCATGATTA | 8 |
ACTAAGGTGGTA | TTGTTTTT | TATTCATTTTAT | 8 |
DNA sequence
GGGGCTGTCCTAGATAATGACTAAAAACTCCATTTAGGTTAAAATAACCCAGTGAGAAAAAGTCGTCTAAGTCAGTACAAACAAAACAAACTCATTGAGC
TGTTTGTTGCAGGTGTTACTGCAAGAACGGCAGCTCAATTAGCCAATGTAAATAAAACAACAGCTGCTTACTATTTTCACCGATTACGCCTACTCATCTA
TCAACACAGTCAGCACCTAGAAATGCTAGATGGCGAAGTTGAAGCTGATGAGAGCTATTTTGGCGGAACACGCAAAGGTAAGTGTGGTCGTGGTGCAAGC
GGTAAGACTGCGGTATTTGGCTTATTAAAGCGAAATGGCAAGGTTTATACCGTTGCCGTACCTAATACAAAGTCAGCCACTTTATTGCCCATTATACGAG
AAAAAGTAAAGCCTGACAGCATTGTTTACACAGATTTCTACGAAAGCTATGATGTGCTTGATGTTAGTGAATTTAATCACTTTGGAATCAATCACAGTAC
GCACTTTGCAGAAAAACAAAATCACATTAACGGAATAGAGAATTTTTGGAATCAGGCAAAACGCCATTTACGCAAATTTAACGGTGTTCCCAAAGAACAC
TTTGAGCTTTATCTTAAAGAATGCGAATGGCATTTTAATAACAGTGACCTTAAATCTCAAATTTCCATTTTAAAACAATTATTTAAGGGCAGTTTGGGTT
AGTTATCTAGGACAGCCCC
TGTTTGTTGCAGGTGTTACTGCAAGAACGGCAGCTCAATTAGCCAATGTAAATAAAACAACAGCTGCTTACTATTTTCACCGATTACGCCTACTCATCTA
TCAACACAGTCAGCACCTAGAAATGCTAGATGGCGAAGTTGAAGCTGATGAGAGCTATTTTGGCGGAACACGCAAAGGTAAGTGTGGTCGTGGTGCAAGC
GGTAAGACTGCGGTATTTGGCTTATTAAAGCGAAATGGCAAGGTTTATACCGTTGCCGTACCTAATACAAAGTCAGCCACTTTATTGCCCATTATACGAG
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TTTGAGCTTTATCTTAAAGAATGCGAATGGCATTTTAATAACAGTGACCTTAAATCTCAAATTTCCATTTTAAAACAATTATTTAAGGGCAGTTTGGGTT
AGTTATCTAGGACAGCCCC
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
651 bp | 216 aa | 52 | 702 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MRKSRLSQYKQNKLIELFVAGVTARTAAQLANVNKTTAAYYFHRLRLLIYQHSQHLEMLDGEVEADESYFGGTRKGKCGRGASGKTAVFGLLKRNGKVYT
VAVPNTKSATLLPIIREKVKPDSIVYTDFYESYDVLDVSEFNHFGINHSTHFAEKQNHINGIENFWNQAKRHLRKFNGVPKEHFELYLKECEWHFNNSDL
KSQISILKQLFKGSLG
VAVPNTKSATLLPIIREKVKPDSIVYTDFYESYDVLDVSEFNHFGINHSTHFAEKQNHINGIENFWNQAKRHLRKFNGVPKEHFELYLKECEWHFNNSDL
KSQISILKQLFKGSLG
Blast result :
Comments
ISMov1 is 93% aa similar to ISMha3.
References
1] ISfinder annotation (2017)
2] Calcutt,M.J. and Foecking,M.F. (2015) Direct GenBank submission.
2] Calcutt,M.J. and Foecking,M.F. (2015) Direct GenBank submission.